Предисловие к русскому изданию | 5 |
Предисловие | 7 |
|
Глава 1. Введение: структура и состав биологических мембран | 9 |
1.1. Роль мембран и их разнообразие | 9 |
1.2. Исторический очерк | 15 |
1.3. Морфология мембран | 18 |
1.3.1. Дифракция рентгеновских лучей | 18 |
1.3.2. Электронная микроскопия | 20 |
Дополнение 1.1 | 22 |
1.4. Выделение мембран | 23 |
1.4.1. Разрушение клеток | 24 |
1.4.2. Разделение мембран | 26 |
Дополнение 1.2 | 30 |
1.4.3. Критерии чистоты мембранных фракций | 31 |
1.5. Состав мембран | 33 |
1.5.1. Мембранные липиды | 35 |
1.5.2. Многообразные функции мембранных липидов | 44 |
1.5.3. Мембранные белки | 45 |
1.6. Резюме | 48 |
|
Глава 2. Структура и свойства мембранных липидов | 49 |
2.1. Жидкие кристаллы | 49 |
2.2. Водно-липидные смеси | 54 |
Дополнение 2.1 | 57 |
2.2.1. Гидратация липидов | 57 |
2.2.2. Фазовые диаграммы однокомпонентных водно-липидных систем | 59 |
2.2.3. Два метода изучения липидного полиморфизма | 60 |
2.2.4. Ориентация полярных головок липидов в бислое | 63 |
2.2.5. Конфигурация и упаковка ацильных цепей в бислое | 64 |
2.2.6. Методы исследования гидрофобной области бислоя | 67 |
2.3. Термодинамика полиморфизма липидных структур | 72 |
2.3.1. Гидрофобные силы | 73 |
2.3.2. Образование мицелл | 75 |
2.3.3. Форма мицелл: почему образуется бислой? | 78 |
2.3.4. Форма липидных молекул | 83 |
2.4. Фазовые переходы в липидных системах | 84 |
2.4.1. Дифференциальная сканирующая калориметрия (ДСК) | 85 |
Дополнение 2.2 | 86 |
2.4.2. Липидные смеси | 91 |
2.5. Модельные мембранные системы | 96 |
2.5.1. Монослои на границе раздела фаз воздух — вода | 97 |
2.5.2. Монослои на твёрдой подложке | 101 |
2.5.3. Плоские бислойные мембраны | 101 |
2.5.4. Плоские бислойные мембраны на твёрдой подложке | 103 |
2.5.5. Липосомы | 103 |
2.6. Резюме | 107 |
|
Глава 3. Мембранные белки: характеристика и структурные принципы | 109 |
3.1. Структура мембранных белков | 109 |
3.2. Очистка мемебранных белков | 111 |
3.2.1. Детергенты | 111 |
3.3. Характеристика очищенных интегральных мембранных белков | 116 |
3.3.1. Молекулярная масса субъединиц (электрофорез в |
ПААГ) | 117 |
3.3.2. Определение молекулярной массы нативного белка с |
помощью гидродинамических методов | 118 |
3.3.3. Метод радиационной инактивации | 121 |
3.3.4. Спектральные методы и вторичная структура | 122 |
3.3.5. Ферментативная активность | 124 |
3.3.6. Четвертичная структура и химическое сшивание | 125 |
3.4. Изучение трёхмерной структуры с помощью рентгеновской |
дифракции и реконструкции изображения | 128 |
3.4.1. Кристаллизация мембранных белков | 128 |
3.4.2. Реконструкция изображения и двумерные кристаллы | 130 |
Дополнение 3.1 | 131 |
3.5. Три примера структурных исследований мембранных |
белков | 131 |
3.5.1. Структура фотосинтетических и реакционных центров |
R. viridis и R. sphaeroides | 134 |
3.5.2. Структура бактериородопсина | 139 |
3.5.3. Структура поринов | 146 |
3.6. Принципы структурной организации мембранных белков и |
способы её предсказания для трансмембранных белков | 148 |
3.6.1. Мембранные белки — это амфифильные соединения | 148 |
3.6.2. Ионизируемые аминокислотные остатки в |
трансмембранных сегментах | 151 |
3.6.3. Заряженные аминокислоты в сегментах, экспонированных |
в водную среду | 152 |
3.6.4. Особая роль пролина? | 152 |
3.6.5. Способы идентификации первичных амфифильных |
структур | 153 |
3.6.6. Способы идентификации вторичных амфифильных |
структур | 157 |
3.7. Пептиды — модели мембранных белков | 159 |
3.7.1. Природные пептиды | 159 |
3.7.2. Модельные синтетические пептиды | 163 |
3.8. Мембранные белки, ковалентно связанные с липидами | 164 |
3.9. Мембранные белки, ковалентно связанные с углеводами | 166 |
3.10. Резюме | 167 |
|
Глава 4, Ассиметрия мембран | 170 |
4.1. Введение | 170 |
4.2. Топография мембранных белков | 171 |
4.2.1. Методология | 172 |
4.2.2. Примеры анализа топографии мембранных белков | 179 |
4.3. Цитоскелет | 181 |
4.3.1. Микрофиламенты | 182 |
4.3.2. Промежуточные филаменты | 183 |
4.3.3. Микротрубочки | 183 |
4.3.4. Мембрана и цитоскелет эритроцитов | 183 |
4.4. Трансмембранная асимметрия липидов | 187 |
4.4.1. Методы установления трансмембранного |
распределения липидов | 188 |
4.4.2. Примеры липидной асимметрии | 190 |
4.4.3. Трансмембранная миграция липидов | 195 |
4.5. Латеральная гетерогенность мембран | 196 |
4.5.1. Макроскопические домены и барьеры в плазматической |
мембране | 197 |
4.5.2. Тилакоидные мембраны | 199 |
4.5.3. Вирусы с оболочкой | 200 |
4.5.4. Липидные микродомены | 201 |
4.6. Резюм | 203 |
|
Глава 5. Динамическое поведение мембранных систем и лилидно-белковые взаимодействия | 204 |
5.1. Введение | 204 |
5.1.1. Некоторые простые модели движения мембранных |
компонентов | 206 |
5.2. Текучесть мембран и применение мембранных зондов | 210 |
5.2.1. Физиологическое значение текучести мембран | 211 |
5.2.2. Характер и скорости движений, измеряемых с |
помощью 2Н-ЯМР, ЭПР и флуоресцентных зондов | 212 |
5.2.3. Спиновые метки, использующиеся для измерения текучести мембран | 214 |
5.2.4. Флуоресцентные зонды, использующиеся для измерения |
текучести мембран | 215 |
Дополнение 5.1 | 216 |
5.3. Вращение мембранных белков | 219 |
5.3.1. Примеры вращения белков | 221 |
Дополнение 5.2 | 222 |
5.4. Латеральная диффузия липидов и белков в мембранах | 222 |
5.4.1. Модели, описывающие латеральную диффузию | 224 |
5.4.2. Примеры латеральной диффузии компонентов мембран | 226 |
5.5. Липидно-белковые взаимодействия | 228 |
5.5.1. Связывание липидов с внутримембранными белками в |
бислое | 229 |
Дополнение 5.3 | 232 |
5.5.2. Изменения в липидном бислое, связанные с |
присутствием интегральных мембранных белков | 234 |
Дополнение 5.4 | 236 |
5.5.3.Динамические свойства остова мембранных белков и их |
боковых цепей | 239 |
5.5.4. Связывание периферических мембранных белков с |
липидным бислоем | 240 |
5.6. Резюме | 242 |
|
Глава 6. Мембранная энзимология | 243 |
6.1. Введение | 243 |
6.2. Некоторые специфические положения, имеющие отношение |
к активности мембранных ферментов | 246 |
6.3. Реконструкция мембранных ферментов | 250 |
Дополнение 6.1 | 251 |
6.3.1. Некоторые характеристики реконструированных |
белково-фосфолипидных везикул (протеолипосом) | 254 |
6.4. Влияние липидов на активности мембраносвязанных |
ферментов | 256 |
6.5. Некоторые примеры липидзависимых ферментов | 259 |
6.5.1. β-Гидроксибутиратдегидрогеназа (БДГ) | 259 |
6.5.2. Пируватоксидаза | 261 |
6.5.3. Са+ -АТРаза | 263 |
6.5.4. Na+ /K+ -ATPa3a | 265 |
6.5.5. Переносчик глюкозы | 267 |
6.6. Мембраносвязанные электронтранспортные цепи | 267 |
6.6.1. Системы синтеза стероидов в митохондриях | 269 |
6.6.2. Микросомные электронтранспортные цепи | 271 |
6.6.3. Дыхательная система митохондрий | 273 |
6.6.4. Фотосинтетическая электронтранспортная система |
тилакоидов | 275 |
6.7. Взаимодействия между мембранами и растворимыми |
ферментами | 277 |
6.7.1. Растворимые ферменты, которые при необходимости |
могут связываться с мембраной | 277 |
Дополнение 6.2 | 279 |
6.7.2. Растворимые ферменты или ферментные ансамбли, |
которые in vivo могут быть ассоциированы с мембраной | 281 |
6.7.3. Факторы свертывания крови — внеклеточные |
ферменты, активируемые связыванием с мембраной | 282 |
6.7.4. Фосфолипазы — растворимые ферменты, |
катализирующие расщепление мембраносвязанных |
субстратов | 284 |
Дополнение 6.3 | 286 |
6.8. Резюме | 288 |
|
Глава 7. Взаимодействие низкомолекулярных соединений с мембранами: пространственное разделение, проницаемость и электрические эффекты | 289 |
7.1. Введение | 289 |
7.1.1. Анализ адсорбции лигандов на бислое | 289 |
7.1.2. Классы лигандов, способных взаимодействовать с |
липидным бислоем | 293 |
7.2. Проницаемость липидных бислойных мембран для |
неэлектролитов | 297 |
7.2.1. Приницаемость для воды | 304 |
7.3. Электрические свойства мембран | 305 |
7.3.1. Работа, совершаемая при переносе иона внутрь |
бислойной мембраны | 308 |
7.3.2. Потенциал внутренних диполей | 309 |
7.3.3. Поверхностный потенциал мембраны | 311 |
Дополнение 7.1 | 316 |
7.4. Трансмембранный, потенциал | 321 |
7.4.1. Измерение трансмембранного потенциала | 323 |
7.4.2. Концепция энергизованной мембраны | 325 |
7.5. Проницаемость липидных бислойных мембран для ионов | 326 |
7.5.1. Проницаемость для протонов | 327 |
7.5.2. Ионофоры | 328 |
7.6. Резюме | 331 |
|
Глава 8. Поры, каналы и переносчики | 332 |
8.1. Общие положения | 332 |
8.1.1. Каналы и переносчики: разнообразие функций | 336 |
Дополнение 8.1 | 338 |
8.1.2. Каналы и переносчики как ферменты: применение |
теории скоростей | 340 |
8.1.3. Анализ стационарного состояния | 346 |
Дополнение 8.2 | 347 |
8.1.4. Регистрация тока, протекающего через одиночный |
канал: встраивание в плоские мембраны и метод пэтч-кламп | 348 |
Дополнение 8.3 | 351 |
8.1.5. Небольшие молекулы, используемые в качестве |
моделей каналов и пор | 353 |
8.2. Несколько примеров пор и каналов | 358 |
8.2.1. Щелевые контакты | 359 |
8.2.2. Ядерные поровые комплексы | 360 |
8.2.3. Порины | 360 |
8.2.4. Никотиновый ацетилхолиновый рецептор |
(nAChR-канал) | 362 |
8.2.5. Потенциалзависимый натриевый канал | 367 |
8.2.6. Кальциевый канал | 370 |
8.2.7. Заключение | 370 |
8.3. Некоторые унипортеры, симпортеры и антипортеры | 371 |
8.3.1. Переносчик глюкозы из мембраны эритроцита | 372 |
8.3.2. Лактозопермеаза из Е. coli | 373 |
Дополнение 8.4 | 375 |
8.3.3. Белок полосы 3-анионный переносчик из мембраны |
эритроцитов | 377 |
8.3.4. Группа митохондриальных переносчиков | 378 |
8.4. Несколько примеров активных переносчиков, использующих |
энергию гидролиза АТР или фосфоенолпирувата | 379 |
8.4.1. Переносчики катионов плазматической мембраны |
(Е1Е2-типа): АТР-зависимые ионные насосы | 382 |
8.4.2. АТРазы F1F0-типа из митохондрий, хлоропластов и |
бактерий | 386 |
8.4.3. Три других класса переносчиков | 388 |
8.5. Активные транспортные системы, сопряжённые с процессом |
переноса электронов или поглощением света | 390 |
8.5.1. Цитохром с-оксидаза: протонный редокс-насос | 390 |
8.5.2. Бактериородопсин: Н+-насос, использующий энергию |
света | 391 |
8.6. Мембранные поры, создаваемые экзогенными агентами | 392 |
8.6.1. Токсины и цитолитические белки | 392 |
8.6.2. Пермеабилизация при помощи детергентов | 394 |
8.6.3. Пермеабилизация при помощи осмотического шока | 394 |
8.6.4. Пермеабилизация под действием электрического поля | 394 |
8.6.5. Пермеабилизация за счёт образования дефектов |
упаковки мембранных компонентов | 394 |
8.7. Резюме | 395 |
|
Глава 9. Клеточная поверхность: рецепторы, рециклирование мембран и передача сигналов | 396 |
9.1. Введение | 396 |
9.2. Поверхность животной клетки | 399 |
9.3. Рецепторы, определяющие клеточную адгезию | 401 |
9.3.1. Связывание бактерий с гликолипидами | 402 |
9.3.2. «Хоминг» лимфоцитов; стволовым кроветворным |
клеткам тоже нужны гликопроизводные | 402 |
9.3.3. Молекулы, участвующие в клеточной адгезии | 403 |
9.3.4. Рецепторы, участвующие в межклеточных |
взаимодействиях при иммунном ответе | 406 |
9.3.5. Интегрины — семейство рецепторов, которые |
связываются с компонентами внеклеточного матрикса и |
белками адгезии | 409 |
Дополнение 9.1 | 410 |
9.3.6. Другие способы связывания с матриксом и белками |
адгезии | 411 |
9.4. Повторное использование (рециклирование) мембран и |
эндоцитоз с участием рецепторов | 412 |
9.4.1. Общие свойства эндоцитозного пути | 413 |
9.4.2. Сортировка компонентов комплекса рецептор — лиганд | 416 |
9.4.3. Клатрин | 420 |
9.4.4. Некоторые примеры интернализуемых рецепторов | 421 |
9.5. Слияние мемебран | 424 |
9.5.1. Работы с липидными везикулами | 424 |
Дополнение 9.2 | 426 |
9.5.2. Изучение белков, входящих в состав шиловидных |
структур оболочки вирусов | 428 |
Дополнение 9.3 | 429 |
9.6. Рецепторные системы бактерий обладают некоторыми |
свойствами, присущими и высшим организмам | 431 |
9.6.1. Рецепторы, ответственные за хемотаксис Е. coli | 432 |
9.6.2. Рецепторы, участвующие в активации транскрипции | 434 |
9.7. Передача сигналов в животных клетках | 435 |
9.7.1. Первичный ответ и семейства рецепторов | 436 |
9.7.2. G-белки | 439 |
9.7.3. Обновление фосфатидилинозитола и вторые |
посредники | 443 |
9.7.4. Фосфорилирование рецепторов и десенсибилизация | 447 |
9.7.5. Некоторые рецепторы, принимающие участие в |
передаче сигналов в животных клетках | 449 |
9.8. Онкогены и передача сигнала | 452 |
9.9. Резюме | 453 |
|
Глава 10. Биогенез мембран | 455 |
10.1. Введение | 455 |
10.2. Общие особенности экзоцитозного пути | 461 |
Дополнение 10.1 | 465 |
10.3. Характерные особенности биосинтеза мембранных белков | 466 |
Дополнение 10.2 | 469 |
10.3.1. Нужны ли для переноса белков каналы? | 472 |
10.3.2. Полипептидные сигналы, отвечающие за сортировку |
белков и встраивание их в мембраны | 475 |
10.3.3. Сигнальные пептидазы | 494 |
10.3.4. Растворимые и мембраносвязанные белки, |
необходимые для переноса | 495 |
10.3.5. Сборка мультисубъединичных комплексов и |
обновление мембранных белков | 498 |
Дополнение 10.3 | 499 |
10.4. Биосинтез и распределение мембранных липидов | 500 |
10.4.1. Где синтезируются мембранные липиды? | 501 |
10.4.2. Транспорт липидов от места их синтеза | 504 |
10.4.3. Обновление фосфолипидов | 509 |
10.5. Изменения липидного состава мембран в ответ на изменения |
условий окружающей среды | 510 |
10.6. Резюме | 511 |
|
Приложение | 513 |
Литература | 514 |
Предметный указатель | 599 |